En affaldstransportør kører affald til det anlæg, som affaldsproducenten eller kommunen anviser. Transportøren overtager ikke ansvaret for, at affaldet materialenyttiggøres eller bortskaffes korrekt. Affaldstransportøren skal ikke indberette affaldsdata, men skal aflevere en erklæring fra affaldsproducenten, så modtageanlægget kan indberette affaldsdata.
Virksomheder, der transporterer affald, skal være registreret i Affaldsregistret.

Vognmandsforretningen får med registreringen ret til at indsamle kildesorteret erhvervsaffald til genanvendelse eller materialenyttiggørelse, men ikke til at behandle affaldet.

Der findes en anden type indsamlingsvirksomhed, som råder over anlæg til forbehandling af affald forud for genanvendelse eller materialenyttiggørelse.
Indsamleren skal levere affaldet videre til en anden godkendt og registreret indsamlingsvirksomhed, eller genanvendelsesanlæg, som er optaget i Affaldsregistret.

Indsamleren skal mindst én gang årligt indberette affaldets mængde, art og fra hvilken virksomhed affaldet kommer.

I alle led, hvor affaldet videregives, skal der indgås en skriftlig aftale mellem parterne om overdragelse af ansvaret for affaldets videre behandling. Det kan i praksis ske i en kontrakt eller ved, at indsamleren på fakturaen skriver, at ansvaret er overdraget og at indsamleren indberetter affaldsdata.

En godkendt indsamler har ligeledes retten til at transportere affald som affaldstransportør.

Virksomheder der ønsker at fungere som affaldstransportør eller indsamler af affald, skal registreres i Affaldsregistret.

Affaldsregistret er et offentligt tilgængeligt digitalt register over genanvendelsesanlæg, indsamlingsvirksomheder, transportører, forhandlere og mæglere på affaldsområdet, samt visse kommunale behandlingsanlæg.

Det er her de affaldsproducerende virksomheder kan se, hvem der må aftage og transportere deres affald.

På Energistyrelsens hjemmeside er det nærmere beskrevet, hvordan en virksomhed bliver registreret i affaldsregistret.